Harry potter 0:55

Hoy me compré Harry Potter 7, lo tenía reservado en FNAC y en la mañana apenas me levante fui a comprarlo, me costó 27 euros, pero vale la pena, no?

Aún no lo termino de leer y por mientras estoy evitando leer sitios de noticias o lugares donde puedan aparecer spoilers.

Zaragoza 0:32

Este miércoles y jueves estuve en Zaragoza por trabajo. Fue bastante agradable y la gente con la que fui a trabajar es muy simpática.

En particular Pablo, que está haciendo un post-doc ahí. El anda en silla de ruedas, no sé cuál es su enfermedad, pero además tiene bastante poca movilidad en los brazos por lo que necesita ayuda a la hora de comer (para que le acerquen los platos y cosas así) o para hacer otras cosas. Sin embargo no parece tener complejo alguno por eso y en realidad es bastante autosuficiente, realmente me impresionó. Además es bastante inteligente y es muy agradable trabajar con él.

Símbolos en Latex 16:22

Encontré algo muy útil, una documento que resume todos(?) los símbolos de LaTeX:

http://www.ctan.org/tex-archive/info/symbols/comprehensive/symbols-a4.pdf

Nadar 10:03

Una de las cosas que me gusta hacer acá en SanSe es ir a nadar, para los que no lo conocen, Donostia está en una bahía llamada "La Concha" (palabra que acá no tiene otros significados) en el medio de la cual hay una isla. Desde la playa cercana a donde vivimos, Ondarreta, son como 500 metros nadando hasta ahí, en la isla es bastante bonito como para hacer un poco de buceo, porque hay bastante rocas y está lleno de peces, he visto calamares y en una ocasión vi hasta un pulpo.

Bugs 15:57

Hoy descubrí un bug bastante crítico en octopus, cuando se usa la paralelización en estados las fuerzas no estaban bien calculadas para átomos con potenciales locales (como el hidrógeno), esto implica entre otras cosas, que unos cálculos largos que estaba corriendo están malos y que tengo que empezarlos de nuevo. Fue a mí mismo que se me coló el bug, cuando implementé una forma más precisa de calcular las fuerzas.

Como primera medida para evitar esto a futuro, puse que varios tests se corran también en paralelo, menos mal que en todos los resultados no cambiaron con respecto al test serial.

Illegal instruction in IA64 11:54

It seems that some Itanium instructions must be emulated by the operating system [1], but of course there are some kernels out there that don't do this and that sometimes your code will stop with:

Illegal instruction

In my case it happened when compiling octopus with my self-compiled gfortran, to avoid the problem I had to compile everything: octopus, blas, lapack, fftw and gcc (the important part is libgfortran) with '-mtune=itanium2'.

Compilando gcc... 22:41

...en 9 minutos:

andrade@*******:/scratch/andrade/src/gcc/build$
time make -j BOOT_CFLAGS='-O2 -mtune=itanium2' \
bootstrap >& build.log

real    8m45.976s
user    92m1.547s
sys     8m34.813s

la máquina tiene 32 procesadores, aunque solo eran las interfaces de C y Fortran.

Odio OS X 19:35

Ya que estamos en esta, contaré que odio Mac OS X, en estos momentos estoy corriendo unos cálculos en un cluster de Mac G5 (una pérdida de plata) y OS X está lleno de esos pequeños detalles que hacen molesto trabajar.

Por ejemplo cp no se porta de la misma forma que el cp de Linux o de otros Unix que he probado (no he probado *BSD eso sí), si copias un directorio (usando -r) no copia el directorio en sí, sino que el contenido.

Otra cosa es que el linker dinámico no es el estándar de Unix, sino que usan una cosa exótica llamada dyld y para más remate es imposible tener binarios estáticos. Los include del sistema son una ensalada y muchos van en /usr/local/, no creo que los desarrolladores de OS X hayan escuchado jamás hablar de FHS.

Partiendo 19:12

Este es mi intento de tener un blog, los que me conocen sabrán que es medio difícil que escriba muy a menudo, pero veremos que pasa.

Más que nada pienso que hablaré de lo que hago la mayor parte del tiempo, programar. Soy físico teórico en el área de la materia condensada (de la 'leche condensada' según mi esposa, Carolina) y estoy haciendo un doctorado en la Universidad del País Vasco en San Sebastián. Como parte del doctorado trabajo en el código científico Octopus y así que me la paso escribiendo código en Fortran y un poco de C y pienso que sería interesante contar sobre eso (que sea interesante leerlo es _otra_ cosa ;-).

Como advertencia les digo que tiendo a ser bastante ahorrativo en palabras, asi que no esperen post muy largos.